Для работы нам потребуются программы:
Apache 2/3 -программа для работы с образами (не путать с HTTP сервером!)
СD/DVD Gen (Sony Computer Entertainment America Inct) - программа для генерации образа или iml карты.
Диск с игрой или образ и виртуальный привод.

Итак начнём!
Рассмотрим сборку диска на примере образа игры Syphon Filter: Dark Mirror.
(Мне попался диск с игрой которая по непонятным причинам жутко тормозила на эмуляторе,
после пересборки этот досадный глюк был устранён.)

*Устанавливаем образ на виртуальный привод если используете образ с ирой.

большинство дисков PS2 скрывают своё содержимое. Здесь естественно такая картина.
Большинство файлов скрыто.

*Запускаем Apache 2 и выбираем интересующий нас привод.
Далее появится список файлов. Обратите внимание на порядок расположение файлов (LBA)
его ,хотя и не критично, но необходимо соблюдать.
Извлекаем файлы на жёсткий диск кликнув на дерево файлов справа право:
правая кнопка мыши->> Extract All

Теперь нам необходимо подготовить iml карту образа

*Запускаем СD/DVD Gen > выбираем новый проет > перетаскиваем файлы согласно LBA (т.е по порядку.
в таком же порядке что мы видели через Apache 2).
Однако, я не стал собирать файлы в нужном порядке, так как заметил что файлы:

SYSTEM.CNF - своего рода авторан для PS2
SCUS_973.62 - исполняемый файл для PS2
GAME_FR.INI - игровые конфигурации

стоят не в начале списка, это не критично, но всё же лучше чтобы они были в самом начале.
Перетаскиваем наши файлы в СD/DVD Gen. Файлы также можно упорядочить по LBA во вкладке "Layout"
во вкладке "Volume" прописываем лейбл диска и другую информацию.

После чего выбираем File->Export iml file и сохраняем iml файл куда угодно.

Теперь подходим к финальной части сборки.

*Вновь запускаем Apache 2 и в меню выбираем File-> Import IML File и импортируем
наш файл созданный в CD/DVD Gen.
После чего выбираем File-> Build ISO, выбираем куда сохранить образ--> сохраняем.

не обращаем внимание на прогресс бар, так как программа немного глючит.

После завершения проверяем: